Tekirdağ Namık Kemal Üniversitesi 17 Mart 2006 tarih ve 26111 sayılı Resmi Gazete ’de yayınlanan 5467 sayılı kanunla kurulmuştur. Bu kanunla, daha önce Trakya Üniversitesi’ne bağlı olan; Ziraat Fakültesi, Çorlu Mühendislik Fakültesi ve Sağlık Yüksekokulu ile Tekirdağ Meslek Yüksekokulu, Çorlu Meslek Yüksekokulu, Çerkezköy Meslek Yüksekokulu, Hayrabolu Meslek Yüksekokulu, Malkara Meslek Yüksekokulu, Marmara Ereğlisi Meslek Yüksekokulu, Muratlı Meslek Yüksekokulu, Saray Meslek Yüksekokulu, Şarköy Meslek Yüksekokulu Tekirdağ Namık Kemal Üniversitesi’ne devredilmiştir.
Aynı yasa ile Tıp Fakültesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Sosyal Bilimler Enstitüsü ve Sağlık Bilimleri Enstitüsü ile Rektörlüğe bağlı Atatürk İlkeleri ve İnkılap Tarihi, Türk Dili, Yabancı Diller, Güzel Sanatlar ve Beden Eğitimi Bölümleri kurularak Üniversitemizin oluşumuna katılmıştır.
Tekirdağ Meslek Yüksekokulu 23.05.2008 tarihinde Teknik Bilimler Meslek Yüksekokulu ve Sosyal Bilimler Meslek Yüksekokulu olarak ikiye ayrılmıştır. 15.04.2009 tarihinde Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksekokulu’nun kurulmuş, geçtiğimiz sene Denizcilik Meslek Yüksekokulunun kurulmasıyla da meslek yüksekokulu sayısı 12’ye yükselmiştir. 02.02.2009 tarihinde yayınlanan Bakanlar Kurulu Kararıyla Yabancı Diller Yüksekokulu kurulması kararı alınmış; aynı kararda ayrıca İktisadi ve İdari Bilimler Fakültesi kurulması kararı ilan edilmiştir. 07.06.2010 tarihinde yayınlanan Bakanlar Kurulu Kararı ile de Güzel Sanatlar, Tasarım ve Mimarlık Fakültesi kurulması kararlaştırılmıştır. 23.06.2012 tarihli ve 28332 sayılı Resmi Gazetede yayınlanan 2012-3209 sayılı Bakanlar Kurulu Kararı ile Veteriner Fakültesi kurulmuştur. Aynı Resmi Gazete’de yayınlanan karara göre ayrıca Beden Eğitimi ve Spor Yüksekokulu kurulmuş, 2021 yılında bu yüksekokulumuz Spor Bilimleri Fakültesine dönüşmüştür. 04.08.2012 tarihli ve 28374 sayılı Resmi Gazetede yayınlanan 2012-3363 sayılı Bakanlar Kurulu Kararı ile de İlahiyat Fakültesi kurulması kararlaştırılmıştır. 27.08.2015 tarihli ve 29458 sayılı Resmi Gazetede yayınlanan 2015-8052 sayılı Bakanlar Kurulu kararı ile Hukuk Fakültesi kurulması kararlaştırılmıştır. Resmi Gazete’nin 11.03.2017 tarihli sayısında 2017/9889 karar sayısı ile yayınlanarak yürürlüğe giren Bakanlar Kurulu Kararı gereğince Üniversitemizde Diş Hekimliği Fakültesi kurulmuştur. Bugün toplam fakülte sayımız 11, yüksekokul sayımız ise 2‘dir.
Tekirdağ Namık Kemal Üniversitesi, 2006 yılında başlayan yapılanma sürecinin ilk çalışmalarını Trakya Üniversitesi Rektörlüğü bünyesinde, daha sonra Tekirdağ’daki Namık Kemal Üniversitesi Uygulama Oteli’nde gerçekleştirmiştir. Rektörlük birimleri 2007 yılının Kasım ayında Tekirdağ merkezinde bulunan eski belediye binasında hizmet vermeye başlamış ve 2008 yılının Ocak ayından 2009 yılının Aralık ayına kadar Değirmenaltı Yerleşkesindeki Ziraat Fakültesi Dekanlık Binasında hizmete devam etmiş, Ocak 2010 tarihinden itibaren Merkezi Derslik binasında hizmet vermeye başlamış, yapımının tamamlanmasıyla birlikte Temmuz 2012 tarihinden itibaren ise yeni Rektörlük binasına taşınmış olup hizmetlerini buradan yürütmektedir.
Öğrencilerimize daha yakından hizmet verebilmek maksadıyla Sağlık Kültür Spor Daire Başkanlığı ile Kariyer Araştırma ve Uygulama Merkezi (NKÜKAM), NKÜTEK Teknopark TGB 1 Kuluçka Merkezi ve Trakya Verimlilik ve İnovasyon Uygulama ve Araştırma Merkezi (TRAVİM) gibi bazı birimler ise Sosyal Yaşam Merkezi içerisinde yer almaktadır.
Kütüphane ve Dokümantasyon Daire Başkanlığı ve bünyesindeki mevcut Merkez Kütüphanemiz ise öğrenci ulaşımı açısından yerleşkemizdeki en merkezi konumda, Merkezi Derslikler binasında yer almaktadır.